Информационно-вычислительная система для анализа генетических данных на основе перестановочного теста

1. Ashburner M., Ball C.A., Blake J.A. et al. Gene ontology: tool for the unification of biology. The Gene Ontology Consortium // Nat Genet. 2000. 25. 25–29.
2. Boreskov A.V., Kharlamov A.A., Markovkiy N.D. et al. Parallel computations on the GPU. CUDA architecture and software model. Moscow: Publ. House of Moscow Univ., 2012. 336 p.
3. Efron B. Nontraditional methods of statistical analysis. Moscow: Finansy i statistika, 1988. 263 p.
4. Good P. Permutation, parametric and bootstrap tests of hypotheses. New York: Springer Verlag, 2005. 315 p.
5. Van Hemert J.L., Dickerson J.A. Monte Carlo randomization tests for large-scale abundance datasets on the GPU // Comput Methods Programs Biomed. 2011. 101. 80–86.
6. Yakimenko A.A., Gunbin K.V., Khairetdinov M.S. Search for the overrepresented gene characteristics: The experience of implementation of permutation tests using GPU // Optoelectronics, Instrumentation and Data Processing. 2014. 50. (1). 123–129.
7. Yakimenko A.A., Khairetdinov M.S., Avrorov S.A. Development of a parallel program to perform a permutation test with the use of GPU // Actual problems of electronic instrument engineering APEIE-2014: abstracts of 12th Int. Conf., Novosibirsk, 2–4 Oct. 2014. Novosibirsk: NSTU, 2014. 1. 723–727.

Ковалевский В.В. – д.т.н., зам. директора по научной работе, зав. лабораторией геофизической информатики, e-mail: kovalevsky@sscc.ru 

Хайретдинов М.С. – д.т.н., профессор, зав.кафедрой сетевых информационных технологий, e-mail: marat@opg.sscc.ru

Якименко А.А. – к.т.н., доцент каф. ВТ, e-mail: yakimenko@corp.nstu.ru

Грищенко М.В. – студент, e-mail: mikhail.grishch@gmail.com