Обнаружение полиморфизма rs78378222 гена ТР53 в опухолевой ткани больных диффузной В-крупноклеточной лимфомой

Авторы: Поспелова Т.И.¹, Воевода М.И.², Воропаева Е.Н.³, Максимов В.Н.⁴, Березина О.В.⁵, Ковынев И.Б.⁶, Маринкин И.О.⁷

Реферат

Известно, что rs78378222 гена ТР53 находится под действием отрицательного естественного отбора, механизмом которого являются злокачественные новообразования. Цель исследования – выявить частоту rs78378222 гена ТР53 в опухолевой ткани диффузной В-крупноклеточной лимфомы (ДВККЛ). Материал и методы. Геномная ДНК выделена из парафиновых блоков биоптатов опухолевых лимфоузлов и экстранодальных очагов поражения 92 пациентов с ДВККЛ методом фенольно-хлороформной экстракции с применением гуанидина. В работу брались срезы ткани, содержащие не менее 80–90 % опухолевых клеток. Генотипирование rs78378222 гена ТР53 проводили методом ПЦР с анализом полиморфизма длин рестрикционных фрагментов. Для подтверждения наличия редкого аллеля С rs78378222 выполняли прямое секвенирование по Сенгеру. Результаты и их обсуждение. Частота выявления rs78378222 в опухолевой ткани ДВККЛ составила 9/92 (9,8 %). Обращало на себя внимание обнаружение у 5 из 9 пациентов минорного аллеля С в гомозиготном состоянии. Поскольку случаи выявления редкого гомозиготного генотипа С/С rs78378222 в нормальной ткани не описаны, полученные результаты свидетельствуют о потере гетерозиготности в гене ТР53 в опухолевой ткани ДВККЛ. Явление потери гетерозиготности в гене ТР53 у носителей гетерозиготного генотипа А/С rs78378222 в опухолевой ткани больных ДВККЛ является примером классического «двухударного» механизма канцерогенеза.

Тэги

ДВККЛ, канцерогенез, rs78378222, секвенирование, теория Кнудсена

Список литературы

1. Копнин Б.П., Копнин П.Б., Хромова Н.В., Агапова Л.С. Многоликий р53: разнообразие форм, функций, опухольсупрессирующих и онкогенных активностей // Клин. онкогематол. 2008. 1. (1). 2–9.

2. Поспелова Т.И., Воевода М.И., Воропаева Е.Н. и др. Значение конституциональных полиморфизмов гена Р53 у больных неходжкинскими злокачественными лимфомами // Бюл. сиб. мед. 2008. 7. (3). 56.

3. Поспелова Т.И., Лосева М.И., Ковынев И.Б. и д?р. Основы опухолевой прогрессии гемобластозов // Бюл. СО РАМН. 2004. 24. (2). 71–73.

4. Avery-Kiejda K.A., Zhang X.D., Adams L.J. et al. Small molecular weight variants of p53 are expressed in human melanoma cells and are induced by the DNA-damaging agent cisplatin // Clin. Cancer Res. 2008. 14. 1659–1668.

5. Chumakov P.M. Versatile functions of p53 protein in multicellular organisms. // Biochemistry. 2007. 72. (13). 1399–1421.

6. Diederichs S., Bartsch L., Berkmann J.C. et al. The dark matter of the cancer genome: aberrations in regulatory elements, untranslated regions, splice sites, non-coding RNA and synonymous mutations // EMBO Mol. Med. 2016. 8 (5). 442–57.

7. Diskin S.J., Capasso M., Diamond M. et al. Rare variants in TP53 and susceptibility to neuroblastoma // J. Natl. Cancer Inst. 2014. 106. (4). dju047.

8. Enciso-Mora V., Hosking F.J., Di Stefano A.L. et al. Low penetrance susceptibility to glioma is caused by the TP53 variant rs78378222 // Br. J. Cancer. 2013. 108. 2178–2185.

9. Gudkov A.V., Komarova E.A. The role of p53 in determining sensitivity to radiotherapy // Nat. Rev. Cancer. 2003. 3. (2). 117–129.

10. International Cancer Genome Consortium, Hudson T.J., Anderson W. et al. International network of cancer genome projects // Nature. 2010. 464. 993–998.

11. Knudson A.G. Mutation and cancer: statistical study of retinoblastoma // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1971. 68. 820–823.

12. Li Y., Gordon M.W., Xu-Monette Z.Y. et al. Single nucleotide variation in the TP53 39 untranslated region in diffuse large B-cell lymphoma treated with rituximab-CHOP: a report from the International DLBCL Rituximab-CHOP Consortium Program // Blood. 2013. 121. (22). 4529–4540.

13. Liang Y., Lin S.Y., Brunicardi F.C. DNA damage response pathways in tumor suppression and cancer treatment // World J. Surg. 2009. 33. 661–666.

14. Macedo G.S., Araujo Vieira I., Brandalize A.P. et al. Rare germline variant (rs78378222) in the TP53 3’UTR: Evidence for a new mechanism of cancer predisposition in Li-Fraumeni syndrome // Cancer Genetics. 2016. 209. 97–106.

15. Stacey S.N., Sulem P., Jonasdottir A. et al. A germline variant in the TP53 polyadenylation signal confers cancer susceptibility // Nat. Genet. 2011. 43. (11). 1098–1103.

16. Ventura A., Kirsch D.G., McLaughlin M.E. Restoration of p53 function leads to tumour regression in vivo // Nature. 2007. 445. (7128). 661–665.

17. Wang Y., Wu X.S., He J. et al. A novel TP53 variant (rs78378222 A > C) in the polyadenylation signal is associated with increased cancersusceptibility: Evidence from a meta-analysis // Oncotarget. 2016. doi: 10.18632/oncotarget.9056. [Epub ahead of print]

18. Wang Z., Rajaraman P., Melin B.S. et al. Further confirmation of germline glioma risk variant rs78378222 in TP53 and its implication in tumor tissues via integrative analysis of TCGA data // Hum. Mutat. 2015. 36. (7). 684–688.

19. Weinstein J.N., Collisson E.A., Mills G.B. et al. The cancer genome atlas pan-cancer analysis project // Nat. Genet. 45. 1113–1120.

Об авторах (для корреспонденции):

Поспелова Т.И. – д.м.н., проф., зав. кафедрой терапии, гематологии и трансфузиологии, е-mail: postatgem@mail.ru

Воевода М.И. – чл.-корр. РАН, д.м.н., проф., директор, е-mail: mvoevoda@ya.ru

Воропаева Е.Н. – к.м.н., научный сотрудник лаборатории молекулярно-генетических методов исследования терапевтических заболеваний, е-mail: vena.81@mail.ru

Максимов В.Н. – д.м.н., проф., зав. лабораторией молекулярно-генетических методов исследования терапевтических заболеваний, е-mail: medik11@mail.ru

Березина О.В. – к.м.н., ассистент кафедры терапии, гематологии и трансфузиологии, е-mail: ovberezina@mail.ru

Ковынев И.Б. – д.м.н. наук, профессор кафедры терапии, гематологии и трансфузиологии, е-mail: kovin_gem@mail.ru

Маринкин И.О. – д.м.н., проф., ректор, е-mail: rector@ngmu.ru

Поступило: 08/11/2016